地域の医師会によって様々ですが、開院地が確定してから申し込む、が開業するDr側にとっては当たり前ですが
【場所を探す段階で相談に来てください】【２年前には申し込みをして下さい】という理不尽と思われる医師会が有りました。
また、開院してから１年間は公費利用の指定医療機関として認めません。（成人病検診・学校検診・小児検診・ワクチン接種割引）
という医師会があり小児科の先生が困って見えたことがございました。
ワクチン接種を実施する医療機関は、予め接種の研修を受けないと指定医療機関としない。という規則が有ります。
研修は、年末もしくは４月に実施される事が多いようです。
申し込みのタイミングを逸すると１年間指定を受けられないという事になりまねませんのでこの時期も把握しておく事が大切です。